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Une ontologie pour organiser les données de processus biologiques: la contribution des modèles mathématiques

Abstract

La biologie est un domaine connu pour sa production massive de données. Ces données sont souvent qualifiées d'hétérogènes et de fragmentées, et les biologistes ne disposent pas d'une représentation formelle, qui, à l'échelle de l'organisme, permettrait de les représenter et de les organiser. Depuis une dizaine d'années les modèles mathématiques systémiques se sont révélés être des outils utiles pour comprendre le comportement de la cellule. Nous montrons dans ce travail qu'une ontologie construite sur les principes qui régissent la conception de ces modèles peut aider à organiser les données biologiques. Nous présentons ici un choix de concepts et relations compatibles avec les principes à l'oeuvre dans les modèles systémiques.
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Dates and versions

hal-04018466 , version 1 (07-03-2023)

Licence

Attribution - CC BY 4.0

Identifiers

  • HAL Id : hal-04018466 , version 1

Cite

Olivier Inizan, Vincent Fromion, Anne Goelzer, Fatiha Saïs, Danai Symeonidou. Une ontologie pour organiser les données de processus biologiques: la contribution des modèles mathématiques. 33es Journées francophones d'Ingénierie des Connaissances, Jun 2022, Saint-Étienne, France. ⟨hal-04018466⟩
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